- 13개의 에피소드와 다양한 스페셜 피처가 담긴 총 4개의 디스크로 구성!
- 치밀한 구성과 끊임없는 반전의 최고 인기 시리즈 <프리즌 브레이크>
- 파나마의 지옥 같은 감옥'소나'를 탈출하기 위한 한층 위험하고 대담한 작전
- 소나에서 재회한 전편의 캐릭터들을 비롯하여, 스코필드가 탈옥시켜야만 하는 의문의 존재와 소냐를 지배하는 세력 등 다채롭고 흥미로운 캐릭터들의 대결

파나마의 감옥 소나에 수감된 마이클 스코필드는 그 곳에 갇혀있는 제임스 휘슬러를 1주일 안에 탈옥시켜야만 사라와 엘제이의 목숨을 구할 수 있게 된다. 이에 마이클이 작전을 계획하자 그의 낌새를 눈치챈 마혼과 티백, 벨릭은 물론이고 감옥의 절대적인 지배자인 레체로가 차례차례 탈출 작전에 가담하게 된다. 마이클이 제한된 시간과 싸우며 위험한 작전을 진행하는 동안, 사라와 엘제이의 행방을 찾아다니던 링컨 앞으로 그녀의 머리가 전해진다. 사라의 죽음을 비밀로 하려던 링컨은 엘제이만이라도 살리고 싶은 다급한 심정에서 마이클에게 사실을 밝힌다. 이에 마이클은 햇빛이 보초의 눈을 가리는 순간을 이용하여 휘슬러를 데리고 탈옥을 감행했다가 실패하고 만다. 마이클의 실패로 초조해진 링컨은 간곡히 사정하여 데드라인을 4일 뒤로 미루지만, 컴퍼니에서는 무력을 사용하여 휘슬러를 빼내기로 하는데...

[에피소드]

[ DISC 1]

1) Orientación(신고식)
2) Fire/Water(물과 불)
3) Call Wating(통화 대기)
4) Good Fence(탈출 통로)

[ DISC 2]

5) Interference(중대한 실수)
6) Photo Finish(참담한 진실)
7) Vámonos(탈옥동지)
8) Bang & Burn(용도 폐기)

[ DISC 3]

9) Boxed In(사리진 희망)
10) Dirt Nap(쿠데타)
11) Under and Out(카운트다운)
12) Hell or High Water(두 개의 길)

[ DISC 4]

13) The Art of the Dead(협상의 기술)

- Season 3: Orientación Featurette : 시즌 3의 첫 번째 에피소드 제작 과정 미니 다큐멘터리
- Break Out Episode Featurette : 12번째 에피소드 제작 과정 미니 다큐멘터리
- Director’s Takes: 에피소드별 주요 장면의 촬영 과정 소개
   Episode 1: Kitchen to Morgue(시체 안치실 장면)
   Episode 2: Whistler & Mahone(휘슬러와 마혼)
   Episode 3: Red Light(링컨의 격투 장면)
   Episode 4: Gravedigger(수잔의 총격 장면)
   Episode 5: T-Bag(티백의 위기)
   Episode 6: Panama(파나마에서의 촬영)
   Episode 7: Car Crash(자동차 충돌 장면)
   Episode 8: Whistler’s Escape(휘슬러 구출 작전)
   Episode 9: Hair/Makeup(분장과 의상)
   Episode 10: Sammy’s Dies(새미의 죽음)
   Episode 11: Rain(비 내리는 장면 만들기)
   Episode 12: Night Escape from Sona(한밤중의 탈출)
   Episode 13: Foot Race(휘슬러의 질주)

- Between Takes: 촬영 막간 배우들의 모습 스케치
Panama(파나마에서의 도미닉 퍼셀) / Jodi Lyn O’keefe(조디 린 오키프) / Chris Vance(크리스 반스) / William Fichtner(윌리엄 픽트너) / Amaury Nolasco(아마우리 놀라스코) / Robert Knepper(로버트 네퍼) / Danay Garcia(대니 가르시아)